數(shù)據(jù)量世界第一 全腦神經(jīng)元三維數(shù)據(jù)庫(kù)建成
編輯: 王瑞穎 | 時(shí)間: 2019-09-16 16:41:41 | 來(lái)源: 科技日?qǐng)?bào) |
神經(jīng)元作為大腦的基礎(chǔ)組成單元,對(duì)研究大腦的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要。以往,受神經(jīng)元標(biāo)注和成像技術(shù)的局限,得到的圖像有較高的噪聲和不均勻的信號(hào)。9月15日,在東南大學(xué)舉辦的2019神經(jīng)元重建及應(yīng)用國(guó)際研討會(huì)中,科技日?qǐng)?bào)記者獲悉,東南大學(xué)腦科學(xué)與智能技術(shù)研究院及東南大學(xué)-艾倫研究所腦數(shù)據(jù)聯(lián)合中心,近日開(kāi)發(fā)了一套基于VR和AI技術(shù)的開(kāi)源精準(zhǔn)數(shù)據(jù)標(biāo)注系統(tǒng)TeraVR,在全腦水平上重建出目前世界最大、最精確的神經(jīng)元三維結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)量世界第一。
想獲取神經(jīng)元形態(tài),通常需要做大腦細(xì)胞的稀疏標(biāo)注、全腦成像、腦圖像可視化、神經(jīng)元形態(tài)重建等。其中,腦圖像的可視化與神經(jīng)元形態(tài)重建是整個(gè)流程中的瓶頸。東南大學(xué)腦科學(xué)與智能研究院客座教授王宜敏介紹,一個(gè)完整的小鼠全腦圖像通常占據(jù)數(shù)十個(gè)Terabytes,猴腦的全腦圖像更是達(dá)到Petabytes量級(jí)。同時(shí),腦神經(jīng)元極為復(fù)雜的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)也進(jìn)一步增加了形態(tài)重建的難度。
“針對(duì)這些挑戰(zhàn),我們基于虛擬現(xiàn)實(shí)及人工智能技術(shù),設(shè)計(jì)并研發(fā)了一套開(kāi)源的半自動(dòng)化全腦神經(jīng)元重建系統(tǒng)TeraVR,能高效精確的從超大規(guī)模腦顯微圖像數(shù)據(jù)中,產(chǎn)生大量全腦神經(jīng)元形態(tài)結(jié)構(gòu)。”王宜敏介紹,科研人員用高分辨率顯微鏡為小鼠大腦切片拍照,再將小鼠大腦中的神經(jīng)元結(jié)構(gòu)提取出來(lái),制作成精準(zhǔn)的三維圖像。利用沉浸式的雙目立體成像,就可以更方便的觀察大腦結(jié)構(gòu),并從中分析出高度復(fù)雜的神經(jīng)元樹(shù)突及軸突的三維投射路徑。
王宜敏表示,“系統(tǒng)顯微圖像的分辨率精度能達(dá)到0.1—0.2微米,而且可以識(shí)別一些通用軟件中存在的重建缺失、過(guò)度重建、拓?fù)溴e(cuò)誤等問(wèn)題。”他說(shuō),目前該系統(tǒng)已經(jīng)重建了1000多個(gè)完整的神經(jīng)元結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)量全球第一。
“對(duì)于大腦神經(jīng)元結(jié)構(gòu)的了解,可以為諸如帕金森癥、阿茲海默癥、漸凍癥等神經(jīng)退行性疾病的診斷治療,提供參考。”王宜敏說(shuō)。(金鳳)
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